Curs de Bioinformàtica per a la Recerca Biomèdica
Informació del curs
Objectius
La recerca biomèdica moderna necessita sovint fer servir informació de diverses menes; per exemple sobre estructures, seqüències, anotacions o funcions de diferents tipus d'entitats i components biològics. Molta d’aquesta informació es troba disponible en bases de dades públiques i el domini de les eines per accedir-hi i recuperar-ne la informació necessària és una habilitat cada cop més imprescindible entre els investigadors en biomedicina.
L'objectiu principal d'aquests curs és proporcionar una perspectiva general dels principals recursos bioinformàtics que poden resultar d'utilitat en el dia a dia de la recerca biomèdica o la pràctica clínica. El seu enfoc és aplicat i el que es persegueix és dotar als investigadors i professionals de la biomedicina de conceptes i eines per saber quan -i com- cal fer servir cadascun d’aquests recursos, o quan és millor buscar suport més especialitzat.
Metodología
Professorat
Continguts del curs
- Sessió 1: Introducció a la bioinformàtica i a les bases de dades en biologia molecular
- Sessió 2: Introducció a les tecnologies de ‘next generation sequencing’ (NGS). Treballant amb dades de NGS. Primeres passes
- Sessió 3: Introducció a l’anàlisis de dades òmiques. Anàlisis de dades de RNAseq amb R i Bioconductor
- Sessió 4: Després de la selecció de gens: Anàlisis de significació biològica
- Sessió 5: Cerca de variants minoritàries
Dates i localització
El curs té una durada de 20 hores i consisteix en cinc sessions de quatre hores. Les sessions es faran els dies 19, 21, 26, 28 de novembre i 3 de desembre de 2018, de 9 a 13:20h a l'aula d’informàtica del Mòdul Sud de la Facultat de Medicina (Pavelló Docent) de l'Hospital Universitari Vall d'Hebron.