Curs de Bioinformàtica per a la Recerca Biomèdica
Informació del curs
Objectius
La recerca biomèdica moderna necessita sovint fer servir informació de diverses menes; per exemple sobre estructures, seqüències, anotacions o funcions de diferents tipus d'entitats i components biològics. Molta d’aquesta informació es troba disponible en bases de dades públiques i el domini de les eines per accedir-hi i recuperar-ne la informació necessària és una habilitat cada cop més imprescindible entre els investigadors en biomedicina.
L'objectiu principal d'aquests curs és proporcionar una perspectiva general dels principals recursos bioinformàtics que poden resultar d'utilitat en el dia a dia de la recerca biomèdica o la pràctica clínica. El seu enfoc és aplicat i el que es persegueix és dotar als investigadors i professionals de la biomedicina de conceptes i eines per saber quan -i com- cal fer servir cadascun d’aquests recursos, o quan és millor buscar suport més especialitzat.
Metodologia
Professorat
Continguts del curs
- Introducció a la Bioinformàtica i a les bases de dades en biologia molecular. Introducció a R i Rmarkdown.
- Introducció a les tecnologies de ‘next generation sequencing’. Treballant amb dades de NGS: primeres passes amb Galaxy.
- Anàlisis de dades en Bioinformàtica
- Cas pràctic I: Anàlisi de variants amb Galaxy
- Cas pràctic II: Anàlisis de dades de RNAseq amb R i Bioconductor
- Després de la selecció de gens: Anàlisis de significació biològica
Dates i horaris
El curs té una durada de 20 hores i consisteix en 5 sessions de 4 hores. Les sessions es faran els dies 20, 22, 27, 29 de novembre i 4 de desembre de 2023, de 9:30 a 13:50h a l'aula 101 del Mòdul Nord de la Facultat de Medicina (Pavelló Docent) de l'Hospital Universitari Vall d'Hebron. El curs es farà en una aula sense ordinadors, de manera que els/les alumnes hauran de portar el seu ordinador portàtil. Tot l’accés al programari necessari per desenvolupar el curs es facilitarà abans de començar el curs per tal que es pugui instal·lar.